临床医学研究中心成立于2023年5月，是集临床及基础研究于一体的综合型研究平台，中心下设科研实验室、临床试验机构及生物样本库三个部门。
科研实验室位于高新院区，占地约3000m2，投资3000万元，现设分子生物学与生物化学、细胞生物学、实验动物中心等三大公共科研平台。细胞生物学平台可为细胞培养，传代，检测（增殖和凋亡等）的操作实验提供平台支撑以及技术指导服务。实验动物中心拥有屏障动物实验室和ABSL-2动物实验室，可进行常规动物模型实验和二级病原微生物感染的动物实验，同时配有小动物行为分析系统、小动物活体成像仪、小动物代谢测量分析系统，小动物血细胞分析仪，脑立体定位系统等动物实验设备，可进行检测常规实验动物指标；生物化学与分子生物学平台可进行常规生化与分子生物学实验，如PCR、琼脂糖凝胶电泳、Western blot、ELISA、免疫共沉淀、免疫荧光和免疫组化等。科研实验室同时拥有激光共聚焦显微镜、组织芯片扫描仪、冷冻切片机、分析型和分选型流式细胞仪和高速冷冻离心机等大型仪器设备。科研实验室从学校、医院学科建设和科学研究的实际需要出发，统筹规划，合理设置，开放共享，统一管理，是医院科研仪器平台和医学研究技术重要支撑部门。
临床试验机构前身为卫生部临床药理基地，1999年9月成功通过国家药品监督管理局的审查，成为云南省首家获得认证的国家药品临床研究基地，迄今为止已发展了包括I期实验室、风湿免疫、精神、皮肤等16个药物临床试验专业及23个器械临床试验专业。为“规范药物临床试验，推动临床研究”，临床试验机构于2023年5月划至临床医学研究中心统一管理，全方位对临床研究的立项、审核、项目进行及结题等环节进行质量控制，同时针对IIT研究成立了学术委员会进行研究方案评审，对IIT项目的方案设计及统计分析等方面提供咨询服务。临床试验机构旨在为临床研究提供规范、合理、高效的研究环境。
生物样本库成立于2018年12月建成并投入使用，是云南省疾病领域首个规范化院级生物样本库，并获得科技部人类遗传资源保藏行政许可。样本库占地面积1000平方米，总投资1000万元，拥有完整的生物样本库功能分区，配备双电路电源、新风系统、冷链温度与环境监控系统以及应急报警系统；配有先进的仪器设备为样本后续储存、深加工和质控提供良好的条件；同时引进了先进的样本信息管理系统，与医院信息系统对接，保障样本信息的准确完善，总存储容量300万份。截止2023年8月生物样本库已存入全院39个科室/病区各类疾病组织、血液、脑脊液、精子、尿液、粪便以及提取物核酸/蛋白质等类型样本1.6万例患者的12万余份样本。
目前，临床医学研究中心共有工作人员25人，博士13人，1人享受云南省政府特殊津贴，多人被评为云南省医学领军人才，云南省医学后备人才，云南省“兴滇英才”青年人才。中心目前博士生导师1人，硕士生导师4人，主持国家基金10项，省级重点项目1项，省基金10余项，发表SCI收录论文30余篇，荣获中国医院协会科技进步奖2项，云南省科技进步一等奖1项、二等奖2项；荣获云南省卫生科技成果奖一等奖2项、二等奖2项。本中心致力于打造基础与临床相结合的研究平台，为医院人才培养、学科建设、科技创新提供重要保障。
香港资料一香港120资料库生殖遗传科成立于2014年8月，现有职工44人，其中博士11人，硕士13人，高级职称9人，博士生导师2人，博士后合作导师1人，硕士生导师6人，云南省高层次人才5人，省厅级学科带头人和后备人才4人，多人在国家和省级社会团体中任职。先后获批“昆明医科大学生殖与遗传创新团队”、“医学遗传学住院医师规范化培训基地”，“黄荷凤院士工作站”，牵头成立了昆医大附一院“生殖医学联盟”，成员单位涵盖了云南和周边省份的50余家三级和二级公立医院。科室连续6年获得医院先进集体称号。2016年3月报道了云南省首例卵子成熟障碍经体外成熟培养试管婴儿成功妊娠病例；自主改进了卵子冷冻复苏方法，卵子复苏率高达97%-99%。科室成员主持国家自然科学基金项目9项，发表SCI论文50余篇，出版专著16部。
科室2016年2月获批夫精人工授精、第一代试管婴儿、第二代试管婴儿技术试运行资质，2017年3月获批正式运行资质，2018年获批供精人工授精技术试运行资质，2019年获批正式运行资质。2022年4月获批第三代试管婴儿技术筹建资质，2023年4月获批第三代试管婴儿技术试运行资质。至此，香港资料一香港120资料库生殖遗传科能够开展包括夫精人工授精、供精人工授精、第一代试管婴儿、第二代试管婴儿及第三代试管婴儿技术在内的全部辅助生殖助孕技术，同时开展不孕不育、优生优育、遗传病诊治及出生缺陷防控、生育力保存等全方位的生殖健康服务。目前是云南省辅助生殖技术资质完善、技术力量雄厚、发展势头强劲的生殖医学中心。
科室目前已完成试管婴儿取卵和移植3万余周期，已出生健康婴儿近7000名，受到社会各界及广大患者的广泛好评。今后，科室将继续秉承“以患者为中心”的服务宗旨，依托优势，稳步发展，为患者提供更优质的全链条辅助生殖技术助孕服务。
