康复医学科具有82年的悠久历史，是昆明医科大学康复医学与理疗学博士学位和硕士学位、医学技术（康复治疗学）硕士学位授予点，2012年成立康复医学科病房，2014年成立呈贡康复医学科，科室拥有康复设备近300类，治疗面积1200平方米，康复医学科现有人数48名，主任医师1名，副主任医师4名，主治医师6名，住院医师1名，康复治疗师25名，康复护士11名，其中博士生3人，硕士12人，本科35人。

康复病种：急危重症早期康复、神经康复，骨科康复，心肺功能康复，老年病康复，肿瘤康复、孕产康复、盆底康复、再生医学、心理康复，言语语言康复、脊柱侧弯康复、神经源性膀胱/直肠康复、血友病康复、亚健康状态，其他慢性病 (慢性疼痛、糖尿病、压疮、痉挛和吞咽障碍)等进行康复。